ProtoLabs grundades 1999 av amerikanen Larry Lukis, en entreprenör och datornörd som radikalt ville minska tiden det tog att tillverka formsprutade prototypdelar av plast.
2014 började företaget även arbeta med 3d-printning och ytterligare några år senare med CNC-fräsning.
Idag finns företaget med en rad hubbar både i Nordamerika och Europa. I Sverige har företaget sin hubb i Nacka utanför Sverige, men här produceras inget. Här arbetar tre medarbetare. All produktion oavsett om det är formsprutning, CNC-fräsning eller additiv tillverkning görs i Tyskland och Storbritannien, för den europeiska marknaden.